Conforme a origem geográfica das variedades, o serviço de quarentena verifica a presença de uma dúzia de agentes patogênicos da cana-de-açúcar, principalmente vírus, bactérias ou fitoplasmas. São agentes responsáveis pelo amarelecimento foliar (YLS), pela escaldadura da folha, pelo raquitismo das soqueiras, pelo mosaico, pelo vírus Sugarcane streak mosaic virus (SCSMV), pela doença de Fiji, pela red leaf mottle , pela estria vermelha, pela Ramu Stunt  ou até por fitoplasmas (white leaf , grassy shoot )...

As variedades são observadas regularmente durante seu crescimento nas estufas de quarentena. A observação visual é combinada a ferramentas de diagnóstico e detecção de alto desempenho.

As doenças latentes

Algumas doenças desenvolvem pouco ou nenhum sintomas em estufa: a escaldadura da folha (Xanthomonas albilineans) , o amarelecimento foliar (Sugarcane yellow leaf vírus)  e o raquitismo das soqueiras (Leifsonia xyli  subsp. xyli)  estão sujeitos a vigilância especial em quarentena. Testes de detecção destes agentes patogênicos foram desenvolvidos.

Uma bateria de testes de detecção

O CIRAD utiliza ambientes de crescimento seletivos, testes sorológicos e métodos moleculares (PCR, RT-PCR) com os quais é possível estabelecer um diagnóstico preciso para as bactérias Xanthomonas albilineans, Leifsonia xyli  subsp. xyli,  os vírus SCYLV, SCMV e SrMV, SCSMV, FDV, PCV, SSV, SSEV, SSMV, MSV e fitoplasmas.

Qual teste para qual doença?

A cada ano, a quarentena de cana-de-açúcar do CIRAD realiza mais de 2000 testes de diagnóstico em laboratório.